More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1169 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
236 aa  470  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.73 
 
 
236 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.17 
 
 
237 aa  229  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.62 
 
 
226 aa  218  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.79 
 
 
204 aa  191  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  44.29 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.17 
 
 
230 aa  187  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
234 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 
238 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  42.58 
 
 
234 aa  180  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  35.61 
 
 
229 aa  142  7e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.88 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
206 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.99 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.52 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
253 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.57 
 
 
246 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
218 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.74 
 
 
206 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.74 
 
 
206 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.15 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.4 
 
 
270 aa  102  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
209 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
339 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  29.8 
 
 
220 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
220 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
199 aa  99.4  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.5 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
208 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.4 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.83 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  29.8 
 
 
220 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  30.3 
 
 
211 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  30.3 
 
 
211 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.23 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.66 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.66 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  27.75 
 
 
201 aa  92  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.78 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 
200 aa  88.6  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.18 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.6 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
224 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  26.21 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.08 
 
 
576 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.65 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.86 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.55 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.55 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.55 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  26.37 
 
 
474 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 
480 aa  82  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.37 
 
 
248 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.14 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.88 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.88 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.88 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.53 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.22 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.84 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.15 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  23.04 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.91 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.91 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.53 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.93 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.12 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25 
 
 
251 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.11 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.1 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.05 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.1 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.76 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.98 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.1 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.54 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.63 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  27 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.02 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.12 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  25 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.07 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.21 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.32 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.47 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.95 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.25 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.19 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  26.01 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.96 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  25.13 
 
 
470 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.84 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>