More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0645 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
206 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.73 
 
 
206 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.5 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 
210 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.65 
 
 
214 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  45.96 
 
 
220 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.96 
 
 
220 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.1 
 
 
218 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  43 
 
 
211 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  43 
 
 
211 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.23 
 
 
206 aa  154  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.65 
 
 
203 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  43.54 
 
 
201 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.21 
 
 
208 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 
208 aa  147  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 
204 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.93 
 
 
207 aa  142  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.31 
 
 
202 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 
220 aa  140  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.15 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 
210 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  41.62 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.52 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.92 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.45 
 
 
238 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.3 
 
 
211 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 
206 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.33 
 
 
211 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.01 
 
 
214 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.3 
 
 
224 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  38.02 
 
 
206 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.3 
 
 
224 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.18 
 
 
238 aa  121  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.1 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.32 
 
 
206 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  38.5 
 
 
213 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
339 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.96 
 
 
209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.45 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.02 
 
 
210 aa  111  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.41 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  36.7 
 
 
470 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.12 
 
 
221 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.18 
 
 
210 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.23 
 
 
212 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.58 
 
 
204 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  33.87 
 
 
474 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.23 
 
 
212 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.41 
 
 
216 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.47 
 
 
241 aa  99  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 
209 aa  97.8  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.96 
 
 
457 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 
252 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
230 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.12 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.15 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.57 
 
 
480 aa  95.5  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.26 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.19 
 
 
246 aa  95.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
235 aa  95.1  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  33.33 
 
 
465 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0436  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40 
 
 
403 aa  93.2  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0887055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.04 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  27.88 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
576 aa  92.8  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  39.83 
 
 
225 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.58 
 
 
279 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  34.34 
 
 
234 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  39.09 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  36.69 
 
 
460 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  39.09 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.11 
 
 
277 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.09 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.98 
 
 
234 aa  89  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 
255 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  28.04 
 
 
228 aa  89  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.73 
 
 
263 aa  88.6  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.66 
 
 
223 aa  87.8  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.66 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
235 aa  87.8  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  32.7 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 
244 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.15 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.13 
 
 
286 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.18 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.23 
 
 
469 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>