More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2150 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.93 
 
 
208 aa  242  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.34 
 
 
214 aa  237  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.94 
 
 
206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  53.96 
 
 
211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  53.96 
 
 
211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.44 
 
 
209 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.96 
 
 
253 aa  224  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.45 
 
 
210 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  49.51 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.61 
 
 
211 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.81 
 
 
200 aa  207  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.5 
 
 
224 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.5 
 
 
224 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.49 
 
 
218 aa  204  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.5 
 
 
224 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.19 
 
 
211 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.26 
 
 
210 aa  194  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52 
 
 
238 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  48.76 
 
 
201 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.02 
 
 
203 aa  190  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.75 
 
 
202 aa  184  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  52.08 
 
 
214 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.41 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.41 
 
 
204 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.55 
 
 
201 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44 
 
 
220 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  44 
 
 
220 aa  165  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.93 
 
 
206 aa  160  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.88 
 
 
231 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.22 
 
 
220 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  41.95 
 
 
206 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.44 
 
 
206 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.18 
 
 
221 aa  154  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  40.98 
 
 
213 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.87 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  41.21 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.02 
 
 
192 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
210 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.06 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.52 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.28 
 
 
210 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44 
 
 
206 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.71 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.71 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.22 
 
 
206 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.22 
 
 
206 aa  135  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.41 
 
 
480 aa  131  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  38.07 
 
 
474 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  37.11 
 
 
465 aa  121  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.63 
 
 
576 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.02 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.59 
 
 
238 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  34.69 
 
 
229 aa  111  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.06 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 
243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  34.7 
 
 
234 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 
218 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 
339 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
200 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
199 aa  104  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.85 
 
 
210 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
209 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.57 
 
 
246 aa  97.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.03 
 
 
257 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.19 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 
279 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  32.32 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.46 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.393099  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  33.98 
 
 
470 aa  95.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0507  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.28 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  29.41 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
478 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.34 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.34 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 
251 aa  92  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 
218 aa  92  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.34 
 
 
233 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.6 
 
 
449 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.97 
 
 
232 aa  91.3  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  31.5 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.06 
 
 
235 aa  89.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
222 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.11 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.16 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.65 
 
 
277 aa  88.2  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.57 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.11 
 
 
286 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.53 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>