More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1920 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
230 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  78.6 
 
 
227 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.6 
 
 
227 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.39 
 
 
223 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.19 
 
 
221 aa  258  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0768  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.34 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  52.83 
 
 
215 aa  237  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.83 
 
 
215 aa  237  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.18 
 
 
225 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
225 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.78 
 
 
217 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 
217 aa  135  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
223 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.7 
 
 
215 aa  92.8  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.97 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.44 
 
 
217 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  44.34 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.75 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.05 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.36 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.04 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3344  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.98 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  32.61 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.61 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.22 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.03 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.14 
 
 
206 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.14 
 
 
206 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.14 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.19 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  28.71 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  28.71 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.71 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  31.79 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.32 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  30.54 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.41 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  30.37 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.1 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.14 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.64 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.12 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.76 
 
 
457 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.51 
 
 
576 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  26.98 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  28.96 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  27.41 
 
 
465 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  30.56 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  25.91 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  25.91 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.79 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.61 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  30.94 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.88 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.05 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  34.31 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.3 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  34.31 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  35.58 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  34.55 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.93 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  34.48 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.28 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  29.59 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  34.62 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.36 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.36 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.65 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  32.81 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  37.23 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.99 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.98 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.48 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.23 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>