More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11810 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
216 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.83 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.7 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  35.86 
 
 
201 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  32.69 
 
 
470 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
214 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.17 
 
 
206 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.73 
 
 
204 aa  104  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.82 
 
 
210 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 
218 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
238 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.56 
 
 
206 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  32.7 
 
 
211 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  32.7 
 
 
211 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.56 
 
 
206 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  32.11 
 
 
234 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.86 
 
 
202 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.07 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.2 
 
 
339 aa  99  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 
206 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  25.93 
 
 
229 aa  98.6  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.21 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.11 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  30.24 
 
 
206 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.94 
 
 
230 aa  95.1  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
203 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.63 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
231 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.06 
 
 
233 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.51 
 
 
210 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.86 
 
 
246 aa  92  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
232 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.44 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.16 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.16 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.43 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.96 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  29.51 
 
 
474 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.13 
 
 
576 aa  89.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.44 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  29.17 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  29.17 
 
 
224 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.11 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.37 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.2 
 
 
236 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
252 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.5 
 
 
252 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30 
 
 
270 aa  85.5  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.57 
 
 
308 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
228 aa  85.1  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  26.73 
 
 
214 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  33.33 
 
 
232 aa  84.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 
249 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  31.16 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.89 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.11 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.75 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.18 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  43.62 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  31.18 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  30.93 
 
 
465 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  25.25 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.62 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.62 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  28.72 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
248 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
227 aa  82  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.83 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.78 
 
 
324 aa  81.6  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.5 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  32.11 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.58 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.83 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  32.8 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.81 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>