More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4237 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
308 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  97.08 
 
 
308 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  96.89 
 
 
308 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.42 
 
 
249 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.71 
 
 
257 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.96 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.26 
 
 
236 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.7 
 
 
232 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0454  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.25 
 
 
227 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0157661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.06 
 
 
233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 
197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.46 
 
 
228 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
230 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 
226 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.1 
 
 
199 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  38.83 
 
 
234 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.57 
 
 
216 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.88 
 
 
238 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  34.87 
 
 
474 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.7 
 
 
204 aa  96.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.16 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.83 
 
 
208 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.66 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1853  biopolymer transport exbB protein  34.5 
 
 
203 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  37.04 
 
 
470 aa  90.1  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 
208 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.02 
 
 
235 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 
251 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.33 
 
 
200 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.43 
 
 
209 aa  86.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.62 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
214 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.66 
 
 
252 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.66 
 
 
252 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.66 
 
 
252 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  31.98 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.54 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.22 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  32.09 
 
 
465 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.57 
 
 
204 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.15 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  33.33 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  33.33 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 
210 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  29.52 
 
 
242 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.54 
 
 
206 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
206 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
223 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  28.78 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.23 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 
480 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  28.78 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  28.92 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.6 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  29.44 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  30.88 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  30.88 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.5 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.63 
 
 
453 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.6 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 
192 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.61 
 
 
218 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  30.3 
 
 
214 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.64 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  32.64 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.26 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.29 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.81 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  30.26 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.24 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.89 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.72 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.79 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.36 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  29.63 
 
 
453 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.91 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  31.16 
 
 
227 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.63 
 
 
209 aa  72  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.3 
 
 
203 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.32 
 
 
206 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 
221 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.79 
 
 
238 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  34.02 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>