More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2482 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  100 
 
 
242 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  95.45 
 
 
255 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  86.78 
 
 
241 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  83.13 
 
 
239 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.89 
 
 
239 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  78.93 
 
 
239 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  78.93 
 
 
239 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  74.69 
 
 
236 aa  348  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  74.69 
 
 
236 aa  348  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  74.27 
 
 
236 aa  346  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  58.8 
 
 
235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.8 
 
 
235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.91 
 
 
234 aa  265  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.17 
 
 
232 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.49 
 
 
244 aa  234  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.48 
 
 
238 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  57.42 
 
 
230 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.89 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.31 
 
 
238 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.97 
 
 
238 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.76 
 
 
240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.75 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.83 
 
 
238 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.82 
 
 
218 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.14 
 
 
218 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.21 
 
 
249 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.21 
 
 
249 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.68 
 
 
224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 
250 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 
223 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.02 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.43 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.87 
 
 
222 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.87 
 
 
222 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  36.95 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 
223 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  36.54 
 
 
253 aa  138  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 
222 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.74 
 
 
254 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 
222 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.41 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.78 
 
 
253 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  37.93 
 
 
307 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.62 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.89 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.98 
 
 
222 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.48 
 
 
222 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
238 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  36.28 
 
 
254 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.86 
 
 
236 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 
238 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 
238 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  37 
 
 
224 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  36.5 
 
 
224 aa  135  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.21 
 
 
242 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.21 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.21 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  36.87 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
238 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 
242 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.21 
 
 
243 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
247 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.41 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.38 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.45 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
241 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  34.83 
 
 
245 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  35.92 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  36.36 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  36.36 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.96 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  39.5 
 
 
242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.89 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.91 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.92 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.42 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.42 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.67 
 
 
233 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.69 
 
 
247 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.22 
 
 
235 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 
301 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.97 
 
 
263 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.87 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.87 
 
 
303 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.79 
 
 
242 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.5 
 
 
311 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.44 
 
 
268 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  36.52 
 
 
263 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.5 
 
 
243 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.87 
 
 
303 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  39.46 
 
 
243 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.04 
 
 
304 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  39.01 
 
 
301 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.88 
 
 
243 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.9 
 
 
235 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.9 
 
 
235 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>