More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0226 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
240 aa  480  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.33 
 
 
238 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  56.39 
 
 
230 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.14 
 
 
238 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.14 
 
 
238 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.22 
 
 
230 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.9 
 
 
234 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.13 
 
 
235 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  56.73 
 
 
239 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  56.73 
 
 
239 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  53.67 
 
 
235 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.24 
 
 
255 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  55.5 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  55.02 
 
 
236 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  55.02 
 
 
236 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  54.76 
 
 
242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.89 
 
 
239 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.86 
 
 
241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.2 
 
 
239 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.12 
 
 
232 aa  184  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.13 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.5 
 
 
218 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.62 
 
 
238 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.38 
 
 
238 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
249 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
249 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.22 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
254 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  45.05 
 
 
307 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.25 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.19 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.38 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.58 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.06 
 
 
266 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.83 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.9 
 
 
242 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
301 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.3 
 
 
301 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  39.27 
 
 
301 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  38.35 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  39.04 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.86 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.72 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.79 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
301 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.1 
 
 
250 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.43 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 
223 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 
223 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.81 
 
 
224 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  41 
 
 
309 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.7 
 
 
230 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.21 
 
 
240 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 
243 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 
307 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 
239 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  34.3 
 
 
232 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 
311 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.74 
 
 
242 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0862  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.43 
 
 
240 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.286551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.58 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.98 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.09 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.51 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.49 
 
 
241 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.19 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.37 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.37 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  32.72 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  34.48 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.75 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
243 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 
243 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.73 
 
 
247 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 
222 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 
222 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  34.6 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.67 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 
242 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.2 
 
 
222 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 
242 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  33.49 
 
 
224 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 
242 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>