More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03475 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  90.55 
 
 
253 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  81.89 
 
 
254 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.89 
 
 
254 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  45.21 
 
 
242 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.1 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.95 
 
 
250 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.08 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.36 
 
 
244 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.36 
 
 
244 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.36 
 
 
244 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
243 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 
243 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.92 
 
 
242 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 
243 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 
243 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.02 
 
 
243 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.91 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.91 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.91 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 
243 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.55 
 
 
243 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.74 
 
 
242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.74 
 
 
242 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.16 
 
 
242 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 
238 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.12 
 
 
253 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.12 
 
 
233 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.92 
 
 
242 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.92 
 
 
242 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.92 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.92 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.92 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.92 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.92 
 
 
234 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.76 
 
 
307 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.06 
 
 
239 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.33 
 
 
301 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.65 
 
 
304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.93 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.19 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.19 
 
 
303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  43.59 
 
 
243 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.19 
 
 
303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  46.67 
 
 
301 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.91 
 
 
309 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.24 
 
 
247 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
238 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  42.48 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 
303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 
238 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 
241 aa  164  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.19 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 
254 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.38 
 
 
230 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  42.65 
 
 
307 aa  161  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.13 
 
 
250 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.63 
 
 
299 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.85 
 
 
247 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.58 
 
 
265 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.19 
 
 
236 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
222 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 
266 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
250 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.03 
 
 
355 aa  154  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43 
 
 
262 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
222 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
263 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
222 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.23 
 
 
253 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.83 
 
 
286 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
301 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.98 
 
 
222 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.98 
 
 
222 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.64 
 
 
246 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.5 
 
 
222 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
222 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  41.62 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.62 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.5 
 
 
244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
214 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0409  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.22 
 
 
235 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0862  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.286551  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.56 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.32 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3269  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.15 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  37.38 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.55 
 
 
235 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.55 
 
 
235 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  37.38 
 
 
236 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.55 
 
 
235 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3454  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.55 
 
 
235 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.61 
 
 
234 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.55 
 
 
235 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3921  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.15 
 
 
219 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  37.38 
 
 
236 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.55 
 
 
235 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>