More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0118 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
241 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.41 
 
 
273 aa  304  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0016  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.59 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.96 
 
 
265 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.94 
 
 
262 aa  235  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  55.4 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.68 
 
 
301 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.52 
 
 
303 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.94 
 
 
301 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.52 
 
 
303 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.49 
 
 
307 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.53 
 
 
303 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.64 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.74 
 
 
309 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.56 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.73 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  52.58 
 
 
301 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.97 
 
 
299 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.4 
 
 
286 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.42 
 
 
355 aa  215  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.44 
 
 
301 aa  214  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.45 
 
 
278 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.32 
 
 
242 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
240 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.8 
 
 
246 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.02 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.75 
 
 
300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.91 
 
 
242 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.37 
 
 
238 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.37 
 
 
238 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
249 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
249 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.8 
 
 
238 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.05 
 
 
239 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.74 
 
 
242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.02 
 
 
238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.84 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 
242 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 
242 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  43.64 
 
 
242 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 
243 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  42.17 
 
 
262 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.79 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.18 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.73 
 
 
243 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.18 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.18 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.18 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.73 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.18 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.18 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.45 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
250 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.13 
 
 
233 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.36 
 
 
243 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.87 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  39.27 
 
 
253 aa  158  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 
246 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  38.52 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.09 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.52 
 
 
254 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  42.6 
 
 
243 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.38 
 
 
222 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.12 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.12 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.65 
 
 
230 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.9 
 
 
253 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 
254 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.06 
 
 
222 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.13 
 
 
250 aa  148  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.01 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.01 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.13 
 
 
222 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.77 
 
 
236 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.12 
 
 
250 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.82 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.28 
 
 
247 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.59 
 
 
237 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.93 
 
 
237 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.02 
 
 
266 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.87 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 
238 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 
238 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.68 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.63 
 
 
214 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  38.07 
 
 
230 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.31 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  40 
 
 
242 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  40.5 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_3269  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 
222 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
241 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
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NC_008782  Ajs_3921  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 
219 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007651  BTH_I1209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.73 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484595  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  38.74 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
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