More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0270 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  99.15 
 
 
235 aa  470  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  85.11 
 
 
234 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.21 
 
 
241 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  61.84 
 
 
239 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  61.84 
 
 
239 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.72 
 
 
239 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.23 
 
 
255 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.79 
 
 
239 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  58.8 
 
 
242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  62.79 
 
 
236 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  62.79 
 
 
236 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  62.33 
 
 
236 aa  261  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.26 
 
 
244 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  55.56 
 
 
230 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.02 
 
 
230 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.03 
 
 
232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.62 
 
 
238 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.67 
 
 
240 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.71 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.75 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.75 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.75 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.6 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.67 
 
 
218 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.95 
 
 
250 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.23 
 
 
250 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.26 
 
 
238 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  40.39 
 
 
253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 
224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
243 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.16 
 
 
240 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.51 
 
 
253 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
243 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  40.62 
 
 
242 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 
253 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.13 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.07 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.75 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.93 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.07 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.07 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.07 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.07 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  37.88 
 
 
223 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.58 
 
 
222 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 
222 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.49 
 
 
238 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.27 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.59 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.27 
 
 
242 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.27 
 
 
242 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.03 
 
 
242 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  40.59 
 
 
254 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.27 
 
 
234 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.27 
 
 
242 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.74 
 
 
242 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.27 
 
 
242 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.27 
 
 
242 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.2 
 
 
242 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.04 
 
 
243 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.21 
 
 
243 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.38 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 
238 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.24 
 
 
311 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 
238 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.79 
 
 
263 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  36.41 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.28 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.28 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.53 
 
 
309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 
243 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.65 
 
 
244 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.65 
 
 
244 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.65 
 
 
244 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  36.95 
 
 
225 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.47 
 
 
253 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 
286 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.11 
 
 
303 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.24 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.41 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.03 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.71 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  40.11 
 
 
243 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.85 
 
 
242 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 
238 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 
233 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 
301 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.68 
 
 
301 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.93 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.7 
 
 
303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>