More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3131 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.9 
 
 
268 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.38 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  29.15 
 
 
211 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  29.15 
 
 
211 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
206 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 
224 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
253 aa  92.8  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 
224 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.26 
 
 
210 aa  89.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.41 
 
 
263 aa  89  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  29.59 
 
 
201 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.06 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.06 
 
 
224 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 
238 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.59 
 
 
211 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.13 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.86 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  28.95 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.79 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.42 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.6 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.41 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.89 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.78 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.51 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.74 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.96 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.96 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.42 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0548  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.44 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.477361  normal  0.119792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.51 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.54 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.92 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.72 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.5 
 
 
207 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.09 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  27.51 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.93 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  40 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.93 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.47 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.51 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.93 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.18 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.49 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  23.49 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  30.82 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.17 
 
 
200 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  27.8 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.59 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  29.11 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  36.51 
 
 
236 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.26 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  32.32 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  38.26 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  38.26 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.51 
 
 
227 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.59 
 
 
236 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  35.24 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
457 aa  62.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.51 
 
 
237 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.55 
 
 
227 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.49 
 
 
218 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  33.9 
 
 
220 aa  62.4  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1825  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.26 
 
 
451 aa  62.4  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  29.02 
 
 
234 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.24 
 
 
226 aa  62  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  39.62 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 
214 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  31.79 
 
 
470 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
201 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 
236 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  20.67 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.13 
 
 
555 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.27 
 
 
192 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  38.61 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.36 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  26.38 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
680 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.97 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  29 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.98 
 
 
201 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.54 
 
 
478 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.91 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  37.62 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.25 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>