More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4594 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  81.78 
 
 
214 aa  344  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.53 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3344  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.37 
 
 
332 aa  92  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.39 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.04 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.02 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.66 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.66 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0768  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50.57 
 
 
234 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.57 
 
 
234 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
215 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.91 
 
 
215 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 
217 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.35 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.35 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.19 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.98 
 
 
253 aa  84.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.16 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  29.8 
 
 
201 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.77 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.12 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.12 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.86 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  32.12 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.12 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.35 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.16 
 
 
488 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
478 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.73 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.35 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.72 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.56 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.65 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  32.64 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.17 
 
 
480 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.92 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  30.24 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  28.5 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.2 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.53 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  28.5 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.81 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  26.75 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  42.71 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.78 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.78 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.99 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.79 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.84 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  39.22 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  39.22 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.22 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.66 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.29 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  33.06 
 
 
137 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.71 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.11 
 
 
607 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.85 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  31.22 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0735  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.58 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  26 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.86 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.74 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.86 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.24 
 
 
655 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  45.68 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  35.25 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.89 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  36.79 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.19 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  46.91 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.19 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.79 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  46.91 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  45.68 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.89 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  39.33 
 
 
453 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.34 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.27 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.61 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.5 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  31.45 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.65 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  42.5 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.5 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  23.5 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.35 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.57 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>