More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0569 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.54 
 
 
233 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.93 
 
 
239 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.06 
 
 
236 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.93 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0454  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.52 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0157661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
308 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
308 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.93 
 
 
232 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.49 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.97 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.34 
 
 
216 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.79 
 
 
199 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 
238 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  49.09 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.55 
 
 
253 aa  88.6  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1853  biopolymer transport exbB protein  33.49 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  29.74 
 
 
229 aa  85.9  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
210 aa  86.3  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.29 
 
 
204 aa  85.1  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.52 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.67 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.82 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.65 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.43 
 
 
457 aa  82.8  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.63 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  31.92 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.65 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.72 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  31.07 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  31.92 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.98 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.52 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.27 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  32.52 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  32.52 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  31.46 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.17 
 
 
480 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.5 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  46.74 
 
 
470 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.5 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.29 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.1 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.4 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  31.25 
 
 
474 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  32.31 
 
 
465 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.37 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.42 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  35.16 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0186  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.63 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.715904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.28 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  33.33 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.4 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.5 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.93 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  42.86 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.56 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.48 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.8 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.59 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.7 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.41 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  30.41 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.34 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  41.07 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.58 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.06 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  30.48 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  32.39 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  31.11 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.5 
 
 
453 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.97 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.5 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  37.38 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  42.39 
 
 
453 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.06 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  44.58 
 
 
455 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  32.23 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.17 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.47 
 
 
576 aa  68.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  32.43 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  29.13 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.58 
 
 
455 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0803  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.86 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>