More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0443 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.49 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 
253 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  34.42 
 
 
245 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.16 
 
 
204 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  38.07 
 
 
232 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.84 
 
 
206 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
251 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  38.43 
 
 
228 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  38.43 
 
 
228 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  38.43 
 
 
228 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 
218 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.1 
 
 
229 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.57 
 
 
247 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  32.57 
 
 
257 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 
228 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  54.08 
 
 
229 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  32.57 
 
 
257 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.06 
 
 
228 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
227 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.54 
 
 
229 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  54.08 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.08 
 
 
229 aa  99.4  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.82 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.53 
 
 
229 aa  98.2  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.98 
 
 
231 aa  98.2  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.06 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  53.06 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  36.41 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.67 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.06 
 
 
228 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.06 
 
 
228 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.96 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  35.92 
 
 
230 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.24 
 
 
255 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.54 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  35.12 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.7 
 
 
151 aa  96.3  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.01 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.92 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  49.48 
 
 
225 aa  95.5  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  37.37 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  37.37 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.02 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.02 
 
 
236 aa  95.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  34.85 
 
 
235 aa  95.1  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  34.18 
 
 
227 aa  95.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.02 
 
 
147 aa  95.1  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.98 
 
 
224 aa  94.7  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.84 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  52.04 
 
 
229 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  34.54 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  31.89 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.8 
 
 
268 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  31.89 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  34.04 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  34.04 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3185  biopolymer transport protein ExbB  33.33 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  54.26 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.16 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  33.17 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  32 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  52.04 
 
 
228 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  59.76 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
228 aa  92  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
227 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
228 aa  92  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
235 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  50 
 
 
228 aa  92  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  31.82 
 
 
223 aa  92  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  52.08 
 
 
230 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
209 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0306  protein TolQ  33.51 
 
 
218 aa  92  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0846201  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.5 
 
 
229 aa  92  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  50 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  50 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  32.54 
 
 
225 aa  91.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  50 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
227 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  50 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.47 
 
 
224 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>