More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2673 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.36 
 
 
206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.88 
 
 
214 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.75 
 
 
208 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.24 
 
 
218 aa  249  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.71 
 
 
210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.07 
 
 
209 aa  238  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  57.64 
 
 
204 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  56.1 
 
 
211 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  56.1 
 
 
211 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.17 
 
 
210 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.96 
 
 
208 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.28 
 
 
238 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 
211 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.8 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.31 
 
 
224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.28 
 
 
200 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.12 
 
 
224 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.67 
 
 
211 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  53.47 
 
 
201 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.19 
 
 
214 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.25 
 
 
220 aa  194  9e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.5 
 
 
203 aa  194  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  49.25 
 
 
220 aa  194  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.78 
 
 
220 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.39 
 
 
207 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.74 
 
 
202 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.26 
 
 
201 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.52 
 
 
204 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  48.74 
 
 
220 aa  184  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.95 
 
 
206 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.93 
 
 
206 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.93 
 
 
206 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  43.75 
 
 
206 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.55 
 
 
206 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.71 
 
 
206 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  44.44 
 
 
213 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.95 
 
 
206 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.93 
 
 
231 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.3 
 
 
210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 
208 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
192 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.08 
 
 
210 aa  141  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.79 
 
 
216 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  40.31 
 
 
470 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.12 
 
 
212 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.12 
 
 
212 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.93 
 
 
214 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.93 
 
 
244 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 
221 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.03 
 
 
207 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.5 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  35.78 
 
 
474 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 
212 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 
576 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.86 
 
 
339 aa  118  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  32.06 
 
 
229 aa  116  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.21 
 
 
480 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
216 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  36.32 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.47 
 
 
478 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
218 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.41 
 
 
453 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  35.1 
 
 
465 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
224 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
224 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
224 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.82 
 
 
199 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.59 
 
 
212 aa  99.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  34.36 
 
 
453 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.55 
 
 
241 aa  99  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.42 
 
 
209 aa  99  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.72 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.82 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.91 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  34.3 
 
 
208 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.79 
 
 
226 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.52 
 
 
251 aa  95.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  36.5 
 
 
451 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
235 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  30.77 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.09 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  37.19 
 
 
455 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.7 
 
 
229 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 
221 aa  92.8  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.02 
 
 
457 aa  92.4  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0869  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.03 
 
 
462 aa  92.4  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.02 
 
 
204 aa  92  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.02 
 
 
263 aa  92  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.75 
 
 
449 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  29.52 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
215 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.76 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.34 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>