More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1460 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
223 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  98.08 
 
 
221 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  60.39 
 
 
230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.39 
 
 
230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  58.17 
 
 
227 aa  256  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.17 
 
 
227 aa  256  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.6 
 
 
215 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.6 
 
 
215 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.48 
 
 
234 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0768  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  57.48 
 
 
234 aa  248  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.69 
 
 
225 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.69 
 
 
225 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.85 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.85 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41 
 
 
223 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.93 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  36.73 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.1 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.25 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.83 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.44 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3344  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.09 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.36 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.27 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.14 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.15 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.18 
 
 
576 aa  72  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.42 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  24.49 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  30.99 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.92 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.51 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.49 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.6 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  27.51 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.64 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.87 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.62 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.19 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.68 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.24 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.74 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1511  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0055126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.26 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.37 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.32 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.01 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  27.93 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
233 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.82 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  35.9 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  31.94 
 
 
470 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  28.49 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  23.59 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.49 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.06 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  35.11 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1606  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.38 
 
 
221 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.84 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  35.11 
 
 
224 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  24.38 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.17 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.74 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.71 
 
 
209 aa  62.4  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  29.57 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.93 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  27.7 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  28.77 
 
 
235 aa  62  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  27.7 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.11 
 
 
202 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  36.89 
 
 
248 aa  62  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.11 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.6 
 
 
248 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.11 
 
 
223 aa  62  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  35.11 
 
 
225 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  30 
 
 
238 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.38 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  28.37 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  28.42 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  30.11 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  30 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37 
 
 
145 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  25.13 
 
 
251 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.14 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.68 
 
 
457 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  29.17 
 
 
453 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>