More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2025 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
247 aa  475  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.65 
 
 
218 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 
209 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.02 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1511  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
221 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0055126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1606  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.41 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.51 
 
 
223 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.51 
 
 
223 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 
151 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49 
 
 
148 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  35.2 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  35.75 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.13 
 
 
146 aa  89.7  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  33.71 
 
 
227 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.96 
 
 
147 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.48 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.93 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.24 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  34.47 
 
 
235 aa  87  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  43.93 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  34.65 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  34.55 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  41.67 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  33.51 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  33.49 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.49 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  33.49 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  29.67 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  29.67 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  34.65 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  34.65 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.57 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 
229 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
224 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.2 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  38.51 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.54 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.69 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  31.9 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  40.35 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.67 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  41.59 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.11 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  35.83 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  39.84 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  39.84 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  39.84 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  39.84 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  35.11 
 
 
301 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  39.84 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  37.33 
 
 
241 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  29.69 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.52 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  29.69 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  29.69 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  39.02 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  39.45 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.34 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  42.11 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  39.02 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.78 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  39.5 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  38.33 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.97 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  38.33 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  33.66 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.02 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  38.33 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  38.97 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  41.9 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.56 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  41.9 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.36 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.56 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  30.85 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  41.9 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  33.33 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  41.9 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  41.9 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.56 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>