More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1370 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 147 aa  286  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.9 
 
 		 151 aa  207  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.32 
 
 		 146 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.21 
 
 		 148 aa  167  5e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.95 
 
 		 218 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.56 
 
 		 209 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  44.09 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.02 
 
 		 209 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  42.52 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  60.26 
 
 		 239 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  58.75 
 
 		 223 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  56.25 
 
 		 263 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  55.29 
 
 		 225 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.19 
 
 		 232 aa  90.5  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  57.5 
 
 		 241 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  40.62 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  39.37 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  52.38 
 
 		 231 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  63.38 
 
 		 236 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  52.38 
 
 		 231 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  52.38 
 
 		 231 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  32.11 
 
 		 239 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.35 
 
 		 240 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  32.11 
 
 		 239 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  52.38 
 
 		 231 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.64 
 
 		 227 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  63.38 
 
 		 236 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  52.38 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 		 231 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 		 221 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.22 
 
 		 268 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.12 
 
 		 229 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  57.89 
 
 		 232 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  52.38 
 
 		 231 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  61.97 
 
 		 236 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  55.29 
 
 		 231 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.94 
 
 		 308 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  52.38 
 
 		 231 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  52.38 
 
 		 231 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  49.41 
 
 		 224 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  49.41 
 
 		 224 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.34 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.49 
 
 		 251 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  46.94 
 
 		 245 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  50.56 
 
 		 236 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.69 
 
 		 240 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  59.21 
 
 		 239 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  50 
 
 		 235 aa  86.7  9e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 		 243 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  49.41 
 
 		 237 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  48.94 
 
 		 232 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  49.41 
 
 		 237 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.12 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.75 
 
 		 246 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  53.33 
 
 		 274 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  52.38 
 
 		 228 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  53.75 
 
 		 243 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  52.38 
 
 		 228 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.94 
 
 		 229 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.84 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  36.84 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  51.72 
 
 		 259 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 		 228 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  52.38 
 
 		 228 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.46 
 
 		 235 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.95 
 
 		 232 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  55.56 
 
 		 225 aa  84.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  46.15 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.42 
 
 		 243 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  55.84 
 
 		 236 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36 
 
 		 218 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  50.57 
 
 		 257 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  52.38 
 
 		 229 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 		 229 aa  84.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 225 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.12 
 
 		 236 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.84 
 
 		 233 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  50 
 
 		 251 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.87 
 
 		 225 aa  84.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.32 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.19 
 
 		 229 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  36.57 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.86 
 
 		 252 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.86 
 
 		 252 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.57 
 
 		 237 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.86 
 
 		 252 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.19 
 
 		 228 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  50.59 
 
 		 228 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.33 
 
 		 238 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  51.19 
 
 		 228 aa  84.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.33 
 
 		 238 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.94 
 
 		 224 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  55.56 
 
 		 224 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.32 
 
 		 311 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>