More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0627 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
149 aa  293  8e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.04 
 
 
150 aa  165  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  55.22 
 
 
144 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.28 
 
 
147 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.33 
 
 
144 aa  147  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.92 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  55.97 
 
 
140 aa  142  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  56.25 
 
 
151 aa  140  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  50.75 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  50.37 
 
 
142 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  48.53 
 
 
137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  48.2 
 
 
142 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  49.64 
 
 
142 aa  134  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  49.62 
 
 
142 aa  134  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  53.57 
 
 
141 aa  133  9e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  53.57 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.31 
 
 
170 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  49.64 
 
 
142 aa  130  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  45.6 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  50.81 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  50 
 
 
145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  44.93 
 
 
142 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.88 
 
 
142 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  49.29 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.34 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.58 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  45.71 
 
 
157 aa  84.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.25 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  35.19 
 
 
237 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  35.19 
 
 
237 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 
236 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.57 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  46.43 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.82 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  39.8 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  41.86 
 
 
240 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  39.8 
 
 
229 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  36.84 
 
 
253 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.7 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.67 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  41.67 
 
 
232 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  39.53 
 
 
222 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  43.3 
 
 
259 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  39.8 
 
 
229 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 
228 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 
228 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 
228 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 
228 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.71 
 
 
228 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.88 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  45.68 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  40.7 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.53 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  42.86 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.36 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.86 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.32 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  43.33 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.46 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  38.46 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.46 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  38.46 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  38.46 
 
 
262 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  38.46 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  38.46 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  38.46 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  42.35 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  40.86 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.33 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  42.35 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  42.35 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  44.05 
 
 
227 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  32.46 
 
 
224 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  32.46 
 
 
224 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  41.89 
 
 
223 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 
366 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  43.48 
 
 
257 aa  67.4  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  37.36 
 
 
225 aa  67  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
235 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  35.09 
 
 
225 aa  67.4  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  43.96 
 
 
228 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 
216 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  40.86 
 
 
227 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.75 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  40.86 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  40.86 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  41.76 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  39.74 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>