More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2280 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  100 
 
 		 157 aa  297  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  69.29 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  65.71 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  68.57 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  60.84 
 
 		 144 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.39 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.24 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  47.06 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  48.91 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.71 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  48.18 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  46.32 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.14 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  41.61 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.44 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.84 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  42.86 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  42.55 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  42.55 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  41.84 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  39.04 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  42.54 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  40.85 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  37.32 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  44.68 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.22 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.48 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.8 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  49.35 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  44.32 
 
 		 257 aa  67.8  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  34.75 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  34.75 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.84 
 
 		 209 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  44.32 
 
 		 259 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  44.32 
 
 		 257 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.68 
 
 		 218 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  44.32 
 
 		 259 aa  67  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  43.68 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  44.83 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  43.68 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  43.68 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.84 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  43.68 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.16 
 
 		 680 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  50.68 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.17 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 		 224 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 		 215 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  42.22 
 
 		 224 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  43.33 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  42.53 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  42.22 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.51 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  49.32 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  49.32 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  49.32 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.43 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.12 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.45 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  45.35 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  37.63 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  49.32 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  49.32 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.45 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  41.38 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  45 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  43.68 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.11 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.74 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  43.48 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1850  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.83962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  43.02 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  41.38 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  41.38 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  36.78 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 227 aa  60.8  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  42.5 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  44.87 
 
 		 274 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  45.95 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  43.84 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  45.95 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  47.3 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  43.84 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  41.57 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.25 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  45.95 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.93 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>