More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1569 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  100 
 
 		 144 aa  280  5.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.34 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  54.01 
 
 		 137 aa  151  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  51.82 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  51.08 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  50.36 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  48.55 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.91 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.8 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  48.46 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.81 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.45 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  45.99 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  45.99 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.14 
 
 		 170 aa  122  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  43.8 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  43.8 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  44.19 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  45.11 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  43.07 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  43.07 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  43.07 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.04 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  45.38 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.1 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  48.18 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.72 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.72 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  45.16 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  45.16 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 224 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  40.86 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  39.8 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.33 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  43.75 
 
 		 257 aa  67.4  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  44.09 
 
 		 227 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  41.67 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  42.5 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  36.19 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  36.19 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  42.5 
 
 		 232 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.97 
 
 		 232 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 224 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  41.57 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  40.66 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.11 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.89 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  42.39 
 
 		 228 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  36.26 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  42.39 
 
 		 228 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  51.95 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  42.39 
 
 		 228 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  41.3 
 
 		 240 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.39 
 
 		 228 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.72 
 
 		 243 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.95 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.39 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.39 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.26 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  42.86 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.02 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 366 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.21 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.3 
 
 		 228 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  40.66 
 
 		 229 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.3 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.3 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  41.57 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.44 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  41.57 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.66 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  39.56 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.66 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  37.63 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  37.62 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.1 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>