More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2157 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.87 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  55.71 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  54.07 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.41 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  51.85 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  54.07 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.7 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  51.85 
 
 		 137 aa  146  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  54.89 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  48.61 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  48.15 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  48.15 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  48.25 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  48.15 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  46.85 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.29 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.2 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  51.18 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  45.93 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.15 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.77 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  45.38 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  45.45 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.97 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.19 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.27 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  41.59 
 
 		 259 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.76 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  46.15 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  46.15 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  45.05 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  37.96 
 
 		 237 aa  77.8  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  37.96 
 
 		 237 aa  77.8  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.05 
 
 		 225 aa  77  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  41.11 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  45.19 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  48.1 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  43.33 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  43.33 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.96 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  44.44 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  42.86 
 
 		 231 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  40.59 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  37.38 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  37.38 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.59 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  42.86 
 
 		 231 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.33 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  42.86 
 
 		 231 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.2 
 
 		 308 aa  72  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  42.86 
 
 		 231 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.32 
 
 		 218 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.68 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  42.22 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.68 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 		 238 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.68 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  41 
 
 		 240 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.1 
 
 		 246 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 232 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.05 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  44.05 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  44.05 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  44.05 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  43.1 
 
 		 243 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.05 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  44.05 
 
 		 262 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  44.05 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  44.05 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 		 234 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  41.18 
 
 		 227 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 224 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.42 
 
 		 268 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  38.66 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  44.05 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  44.05 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  42.86 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  44.05 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  38.89 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  47.44 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0772  protein TolQ  44.05 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  37.74 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  39.39 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.05 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.68 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  44.05 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  37.74 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  40.66 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  37.74 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  44.05 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.74 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.05 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>