More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3061 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  100 
 
 		 142 aa  275  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  74.65 
 
 		 142 aa  219  9e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  76.06 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  62.86 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.57 
 
 		 144 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.43 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  69.29 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  48.92 
 
 		 142 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.92 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.85 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.64 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.72 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  46.76 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  47.14 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  47.06 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  48.51 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  47.29 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  45.99 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  44.85 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  43.8 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  46.56 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  45.8 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  45.45 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  41.91 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  45.93 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.52 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.31 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.37 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.06 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.05 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.19 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  40.95 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  40.38 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  44.74 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  39.6 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  39.25 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  39.25 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  43.75 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  39.42 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  39.42 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  40.91 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  40.91 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  40.91 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  40.91 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  41.38 
 
 		 257 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  36.54 
 
 		 259 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 218 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  40.23 
 
 		 259 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  41.38 
 
 		 257 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  39.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  40.21 
 
 		 238 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 		 268 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  46.58 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 		 243 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  46.58 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  38.32 
 
 		 227 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  46.58 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  46.58 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  37.62 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  39.25 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  46.48 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  34.95 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  34.95 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.53 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.48 
 
 		 237 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 221 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  40.48 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2191  Tol-Pal system TolQ  40.91 
 
 		 226 aa  62  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000779627  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  43.53 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  41.86 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  45.21 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.11 
 
 		 225 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  41.67 
 
 		 274 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.79 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  41.86 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.48 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  41.86 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  40.79 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  37.36 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.36 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.48 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  35.92 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  35.92 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.22 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  38.46 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 246 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.76 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  37.76 
 
 		 235 aa  60.8  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.76 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  38.64 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  38.64 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>