More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1649 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  100 
 
 
145 aa  286  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  75 
 
 
141 aa  220  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  75 
 
 
141 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  75.71 
 
 
145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  71.83 
 
 
143 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  61.7 
 
 
142 aa  185  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  60.29 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  62.59 
 
 
140 aa  176  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  59.85 
 
 
137 aa  166  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  57.46 
 
 
142 aa  154  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.8 
 
 
170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  55.71 
 
 
142 aa  150  5e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  49.3 
 
 
151 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.59 
 
 
150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.12 
 
 
144 aa  123  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.96 
 
 
147 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  41.91 
 
 
142 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  38.46 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  43.07 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  46.85 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  41.18 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.79 
 
 
142 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  49.44 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  49.44 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.09 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  48.31 
 
 
257 aa  81.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  48.31 
 
 
259 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.99 
 
 
598 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.71 
 
 
585 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  50 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  41.57 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.44 
 
 
607 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  41.57 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  40.74 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  40.74 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  41.57 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  41.57 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  41.94 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  42.7 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.7 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  41.94 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.94 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  41.57 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.94 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.36 
 
 
555 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 
232 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  41.57 
 
 
231 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  41.57 
 
 
231 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
230 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 
232 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  42.05 
 
 
225 aa  73.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.05 
 
 
594 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.45 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  44.19 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.62 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  49.37 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.21 
 
 
680 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  41.35 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  49.37 
 
 
257 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  49.37 
 
 
257 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 
671 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  43.02 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  40.91 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1850  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.83962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  41.18 
 
 
240 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.71 
 
 
231 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.37 
 
 
247 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.45 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  40.91 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  40.91 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
235 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.56 
 
 
655 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 
225 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  40.91 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.05 
 
 
229 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.77 
 
 
228 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  37.86 
 
 
238 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 
268 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  39.77 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  42.05 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  39.78 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  40.44 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.02 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.02 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  38.71 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.3 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  39.45 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  48.68 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>