More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1465 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 144 aa  288  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.93 
 
 		 147 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  62.14 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  58.57 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  57.14 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.86 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.33 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.36 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.79 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  49.26 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  48.91 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.53 
 
 		 170 aa  131  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  46.32 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  44.37 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  43.66 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  40.69 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  44.12 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  40.56 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  44.78 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  44.12 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  44.27 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  42.75 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  43.51 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  48.2 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  58.39 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.09 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.31 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.28 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.87 
 
 		 607 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.05 
 
 		 680 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 		 268 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.55 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  42.7 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  47.44 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  40.59 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  42.5 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  40.86 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  40.86 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  40.23 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 		 555 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.86 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  43.68 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  44.83 
 
 		 259 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 655 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  40.38 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.5 
 
 		 594 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.21 
 
 		 209 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  42.53 
 
 		 225 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  42.53 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  42.53 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.79 
 
 		 234 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  42.53 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  44.83 
 
 		 257 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  42.53 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  37.23 
 
 		 235 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.23 
 
 		 235 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  45 
 
 		 274 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  45.68 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.33 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  42.53 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 671 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.86 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  45.95 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  45.95 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.91 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  43.68 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  43.68 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  45.95 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  43.21 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.5 
 
 		 585 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.35 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.35 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  47.95 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  46.91 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.35 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.35 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.79 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  45.24 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.24 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.21 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 		 598 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  39 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  39 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.57 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>