More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0718 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  61.15 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  60 
 
 		 140 aa  164  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  58.27 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.09 
 
 		 143 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  53.9 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  55.71 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  55.47 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  52.48 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  52.48 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  55.64 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  51.82 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  51.43 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.59 
 
 		 170 aa  141  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.14 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.62 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.2 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  45.32 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  47.29 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  46.04 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  48.85 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.12 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  54.89 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.06 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.66 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.16 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.85 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.74 
 
 		 585 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.59 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  43.38 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.99 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  44.32 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  41.3 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  45.78 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  45.78 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.56 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  34.58 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  34.58 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  47.56 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  41.75 
 
 		 257 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 598 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.86 
 
 		 235 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  41.75 
 
 		 257 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  44.32 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  45 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  39.81 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 		 555 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  47.19 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 		 228 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  42.27 
 
 		 228 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  40.62 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.24 
 
 		 229 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  42.05 
 
 		 239 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 		 223 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 		 223 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  38.14 
 
 		 227 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  38.14 
 
 		 224 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.56 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  37.62 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.24 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.68 
 
 		 607 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  37.62 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  37.62 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  39.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  37.62 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  42.05 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  39.22 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  37.62 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.07 
 
 		 655 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.21 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.96 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  37.25 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  37.25 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  37.62 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  37.89 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  40.91 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  40.82 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  35.71 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.21 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.07 
 
 		 680 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  40.7 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  37.11 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 		 594 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 308 aa  64.7  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.24 
 
 		 671 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.32 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  37.11 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  41.57 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>