More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0517 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1523  ExbBTolQ family transport protein  58.16 
 
 		 199 aa  207  7e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000117252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0689  ExbBTolQ family transport protein  51.55 
 
 		 192 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00337  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0919  ExbBTolQ family transport protein  59.48 
 
 		 155 aa  180  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.014762  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0144  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000207566  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0116  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000187763  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0104  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50 
 
 		 184 aa  175  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  65.69 
 
 		 135 aa  174  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0197  TonB system transport protein ExbB  48.65 
 
 		 186 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000967122  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  45.19 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  43.22 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.11 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  56.52 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  57.53 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.29 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.29 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.84 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.42 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.17 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.17 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  34.19 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.28 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.11 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.28 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  59.68 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  39.32 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  59.68 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  48.68 
 
 		 251 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  45.57 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  36.62 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  43.82 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  43.82 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  43.82 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.78 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  43.82 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  32.52 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  33.33 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  34.88 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  45.56 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  39.81 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.25 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  42.45 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  46.25 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  44.44 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  44.19 
 
 		 253 aa  72  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  44.44 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  46.25 
 
 		 235 aa  72  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  36.84 
 
 		 327 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  40 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 288 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3562  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.05 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.93 
 
 		 235 aa  72  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  44.44 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  40 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.09 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  53.23 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  53.23 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  35.92 
 
 		 326 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  47.5 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  40.57 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.91 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.21 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  35.92 
 
 		 320 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  43.04 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.94 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.79 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.76 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  43.04 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  48.75 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  54.69 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.27 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  48.1 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  56.16 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  46.67 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  58.73 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.9 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  46.67 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  44.44 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  37.8 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.69 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  52.86 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.21 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10630  tonB-system proton channel, ExbB  36.62 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0184871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>