More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1248 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  69.93 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  61.81 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  57.14 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  56.43 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.28 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.27 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.55 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.79 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  50 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  48.2 
 
 		 142 aa  133  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  43.8 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  48.87 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  48.18 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  46.32 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  45.07 
 
 		 142 aa  126  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.21 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  42.96 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  45.8 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  45.04 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  45.04 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  44.85 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  43.51 
 
 		 143 aa  116  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  53.24 
 
 		 157 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  48.15 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.52 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  47.13 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  48.28 
 
 		 257 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  48.28 
 
 		 257 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  45.98 
 
 		 259 aa  76.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  44.05 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  44.05 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  44.05 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  44.05 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.24 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  44.44 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.43 
 
 		 680 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 252 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  42.53 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 252 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.57 
 
 		 598 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 252 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.58 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  47.37 
 
 		 232 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 235 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  41.38 
 
 		 231 aa  70.1  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 		 234 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  44.05 
 
 		 231 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  44.05 
 
 		 231 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  42.53 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  42.53 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  49.3 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  49.3 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  43.27 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  41.94 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  41.94 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  43.01 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.37 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.33 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  41.3 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  43.02 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  43.01 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  43.27 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5306  ferric siderophore transport system protein ExbB  43.27 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  42.53 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.78 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  42.53 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  43.27 
 
 		 318 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.27 
 
 		 320 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  43.33 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.41 
 
 		 317 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  42.53 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 		 585 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  42.86 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.89 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.37 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.12 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  43.33 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.14 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.71 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  43.96 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  46.25 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>