More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2666 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  100 
 
 		 142 aa  278  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  74.65 
 
 		 142 aa  219  9e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.35 
 
 		 142 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  59.29 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.2 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  45.32 
 
 		 142 aa  133  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.85 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  65.71 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  44.85 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  44.12 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  44.12 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.6 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  44.03 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  43.8 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  43.8 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  41.18 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  41.18 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  41.98 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  40.46 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  41.22 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  40.91 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  45.45 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.37 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.73 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.01 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.19 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  41.3 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  43.9 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  41.67 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  41.67 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  36.36 
 
 		 257 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  42.05 
 
 		 239 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 		 268 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  44.16 
 
 		 232 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  36.36 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  40.74 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  41.11 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.78 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  39.77 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  33.94 
 
 		 259 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  45.21 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  40.23 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.25 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  36.78 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  39.29 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  39.29 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  42.05 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  39.29 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  39.29 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  44.59 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  40.91 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  39.53 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  44.59 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  44.59 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  43.24 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  43.24 
 
 		 236 aa  60.1  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.78 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  37.93 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  42.7 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.93 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  37.93 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.06 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  37.93 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  43.24 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  37.23 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  39.77 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  38.75 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  35.56 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  39.76 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  39.77 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  38.75 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  45.07 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  37.96 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.93 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  35.24 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  35.24 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.75 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.21 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.56 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  38.98 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.21 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  46.81 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>