More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0880 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  100 
 
 
140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  69.12 
 
 
142 aa  196  7.999999999999999e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  67.65 
 
 
142 aa  195  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  68.61 
 
 
137 aa  193  7e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  66.91 
 
 
142 aa  184  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  61.43 
 
 
141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  61.43 
 
 
141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  62.14 
 
 
145 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  62.59 
 
 
145 aa  176  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  61.83 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  60 
 
 
142 aa  164  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.28 
 
 
143 aa  152  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.71 
 
 
170 aa  149  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  53.68 
 
 
151 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.97 
 
 
149 aa  142  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.43 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  48.55 
 
 
144 aa  138  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.26 
 
 
144 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
147 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  55.71 
 
 
146 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  47.06 
 
 
142 aa  130  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  44.85 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  47.06 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.1 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 
147 aa  90.1  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.23 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.77 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  42.86 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.84 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  50 
 
 
259 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  49.43 
 
 
257 aa  76.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  50 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  48.28 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  39.81 
 
 
224 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  40 
 
 
223 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  39.81 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.31 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.31 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.19 
 
 
576 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 
268 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.37 
 
 
585 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  39.25 
 
 
225 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.05 
 
 
223 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  37.96 
 
 
227 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.25 
 
 
224 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.05 
 
 
223 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.5 
 
 
555 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.82 
 
 
607 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  34 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
680 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33 
 
 
235 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.74 
 
 
598 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.21 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  37.96 
 
 
245 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.56 
 
 
234 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.89 
 
 
655 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.5 
 
 
671 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 
235 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  38.46 
 
 
232 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 
209 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
255 aa  66.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.7 
 
 
243 aa  66.6  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  38.89 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
480 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.91 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  38.89 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  35.92 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  37.37 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  38.83 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  38.64 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.7 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  38.64 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  38.71 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  38.64 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  39.53 
 
 
474 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.35 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  38.64 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0069  TonB system transport protein ExbB  36.27 
 
 
318 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 
308 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  43.75 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  35 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  43.75 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  39.62 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  37.36 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.27 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.36 
 
 
231 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  45.45 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.55 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 
233 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 
366 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  51.28 
 
 
243 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>