More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0394 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  82.39 
 
 
142 aa  239  7.999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  74.45 
 
 
137 aa  204  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  69.12 
 
 
140 aa  196  7.999999999999999e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  61.7 
 
 
145 aa  185  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  67.67 
 
 
142 aa  184  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  60.87 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  61.31 
 
 
141 aa  179  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  62.04 
 
 
145 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  61.76 
 
 
143 aa  179  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  61.15 
 
 
142 aa  167  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  55 
 
 
151 aa  157  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.62 
 
 
143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.24 
 
 
170 aa  152  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.82 
 
 
150 aa  148  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  51.08 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  48.92 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.37 
 
 
149 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  48.59 
 
 
144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  54.07 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.37 
 
 
144 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.07 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  44.12 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.67 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  46.32 
 
 
157 aa  83.6  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.98 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.03 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.65 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  41.03 
 
 
257 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  46.81 
 
 
259 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  47.31 
 
 
259 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  40.17 
 
 
257 aa  73.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  40.66 
 
 
231 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  40.66 
 
 
231 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  40.66 
 
 
231 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  40.66 
 
 
231 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.65 
 
 
585 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
598 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.58 
 
 
594 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  45.12 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.95 
 
 
555 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  38.46 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
221 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.91 
 
 
224 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  44.58 
 
 
224 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  34.86 
 
 
235 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  38.37 
 
 
224 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  38.37 
 
 
224 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.29 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  44.58 
 
 
224 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  38.24 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.86 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  38.46 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.21 
 
 
655 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  39.29 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  42.17 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  41.94 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  40 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  40 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  39.29 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  45.68 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.76 
 
 
607 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  37.36 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  41.67 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.18 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.81 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  37.36 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.68 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
671 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  44.29 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.43 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  37.25 
 
 
239 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.78 
 
 
232 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 
231 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 
236 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.24 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.02 
 
 
238 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  36.17 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  39.13 
 
 
222 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  40.48 
 
 
236 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 
233 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  42.05 
 
 
228 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
225 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
229 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
230 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 
229 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.02 
 
 
238 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.55 
 
 
225 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 
229 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>