More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1002 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 143 aa  283  5.999999999999999e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  56.34 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  58.09 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  55.15 
 
 		 137 aa  157  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.7 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  53.62 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  53.28 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  53.68 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.23 
 
 		 170 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.92 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  51.09 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.79 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.79 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  50 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  47.14 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  49.62 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  48.85 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  49.62 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  44.85 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  43.38 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  44.85 
 
 		 142 aa  130  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  43.38 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.7 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  47.41 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.56 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  40.44 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  40.4 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  39.09 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  44.32 
 
 		 257 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  39.33 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.04 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  44.32 
 
 		 257 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  43.02 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  41.77 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  41.77 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  41.77 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  37.76 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  37.76 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  43.84 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 		 251 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  44.59 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  44.59 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  32.82 
 
 		 263 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.93 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  33.98 
 
 		 235 aa  67  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.25 
 
 		 233 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 223 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 223 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  39.18 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.77 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  47.3 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.33 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.55 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  38.82 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  38.82 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.06 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  37.93 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  42.35 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.59 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3639  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  41.11 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.01 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  37.78 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0826  tonB-system energizer ExbB  41.33 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.11 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  37.23 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  42.11 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  40.74 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  37.78 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 233 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.97 
 
 		 294 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  37.78 
 
 		 236 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  37.35 
 
 		 251 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 		 286 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  42.11 
 
 		 240 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.06 
 
 		 243 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.78 
 
 		 224 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.33 
 
 		 317 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 		 252 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5354  tonB-system energizer ExbB  41.33 
 
 		 326 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.325713  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  34.48 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  37.21 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  37.11 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  41.33 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  37.11 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  37.11 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.33 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>