More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0847 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  100 
 
 
137 aa  267  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  74.26 
 
 
142 aa  206  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  74.45 
 
 
142 aa  204  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  68.61 
 
 
140 aa  193  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  64.44 
 
 
142 aa  169  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  59.56 
 
 
143 aa  167  4e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  59.85 
 
 
145 aa  166  1e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  56.2 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  56.2 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  56.93 
 
 
145 aa  160  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.15 
 
 
143 aa  157  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  54.01 
 
 
144 aa  151  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  55.47 
 
 
142 aa  150  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.36 
 
 
170 aa  138  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  51.49 
 
 
151 aa  135  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.53 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.74 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  48.18 
 
 
144 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.32 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.32 
 
 
147 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  44.12 
 
 
142 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  44.85 
 
 
142 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  51.85 
 
 
146 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.93 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  47.06 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.19 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.6 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.6 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  46.15 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  39.17 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  38.33 
 
 
257 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  45.05 
 
 
259 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.2 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.91 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.11 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42 
 
 
235 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  39.36 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  40.23 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  40.23 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  40.23 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  40.23 
 
 
231 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.58 
 
 
585 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
555 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  39.08 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  39.08 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.54 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  40.91 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.84 
 
 
232 aa  67.8  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 
598 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 
680 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.47 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  32.74 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  41.86 
 
 
224 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  41.86 
 
 
224 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  40.91 
 
 
225 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.33 
 
 
229 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  38.89 
 
 
237 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  38.89 
 
 
237 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.21 
 
 
655 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  37.93 
 
 
231 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.93 
 
 
231 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  40.62 
 
 
231 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  38.3 
 
 
227 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.51 
 
 
607 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 
224 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.7 
 
 
223 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.7 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  39.08 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.27 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  39.08 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 
671 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  39.08 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  37.93 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  37.93 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  40 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.24 
 
 
594 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  43.33 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  40 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  34.38 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  40.23 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.68 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  45 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  38.64 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  45 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  45 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1850  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.83962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>