More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0278 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 150 aa  299  1e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.04 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.7 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  52.82 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  52.82 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  56.39 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.36 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.55 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  54.89 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  53.38 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  49.29 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  48.92 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  51.43 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  51.15 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  47.14 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  48.92 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.62 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  50.74 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  49.62 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  44.59 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  47.45 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  44.6 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  50.7 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.04 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.09 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.79 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  45.26 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.71 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.88 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.88 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.88 
 
 		 228 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.88 
 
 		 228 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  39.8 
 
 		 229 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.58 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.43 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.74 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  39.42 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.57 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  37.76 
 
 		 229 aa  72  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0936  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.53 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  43.02 
 
 		 274 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.76 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  38.46 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  38.46 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  41.76 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  42.35 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  42.35 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  42.35 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  43.59 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  32.46 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  32.46 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  36.73 
 
 		 227 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  36.73 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 		 228 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  41.76 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 		 313 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.03 
 
 		 233 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  36 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.63 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  35.56 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.58 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  41.76 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  39.76 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  35.56 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.14 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.3 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2357  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.243878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 363 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  33.63 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  40.86 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.7 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  42.86 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  36 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  39.76 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  38.54 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  45.78 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  36.63 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  45.78 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.87 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.87 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  35.92 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.87 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  41.03 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  41.11 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.11 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  39.08 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 355 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  39.08 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>