More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2067 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
148 aa  299  7.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.03 
 
 
146 aa  179  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.36 
 
 
151 aa  169  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.21 
 
 
147 aa  167  6e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.54 
 
 
218 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
147 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
209 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.09 
 
 
144 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.79 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  42.97 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  49.51 
 
 
239 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  56.25 
 
 
232 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.88 
 
 
268 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  39.1 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.95 
 
 
233 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.66 
 
 
240 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.72 
 
 
209 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.45 
 
 
251 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  54.02 
 
 
236 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  54.02 
 
 
236 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.72 
 
 
308 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  55.7 
 
 
223 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  42.19 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.75 
 
 
240 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47 
 
 
247 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.54 
 
 
243 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  52.87 
 
 
236 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  44.66 
 
 
239 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
313 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60 
 
 
225 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55 
 
 
235 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  57.14 
 
 
228 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.84 
 
 
224 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  57.14 
 
 
228 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  57.14 
 
 
228 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 
228 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  50 
 
 
224 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  50 
 
 
224 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.41 
 
 
228 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.41 
 
 
228 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.17 
 
 
236 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  50.59 
 
 
225 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.41 
 
 
228 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  58.9 
 
 
231 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  39.37 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  49.4 
 
 
245 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  40.5 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.41 
 
 
228 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  51.72 
 
 
239 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.55 
 
 
229 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  39.23 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  55.84 
 
 
220 aa  84.7  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.09 
 
 
224 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.85 
 
 
232 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.84 
 
 
223 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.84 
 
 
223 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.84 
 
 
228 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.78 
 
 
234 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  50.57 
 
 
239 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  51.95 
 
 
303 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  55.41 
 
 
237 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  52.17 
 
 
229 aa  84  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  55.41 
 
 
237 aa  84  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  48.39 
 
 
229 aa  84.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  46.67 
 
 
225 aa  83.6  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  48.78 
 
 
239 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  49.45 
 
 
229 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.96 
 
 
229 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  48.78 
 
 
239 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  47.67 
 
 
227 aa  83.6  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.15 
 
 
230 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.66 
 
 
229 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.62 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  51.85 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  51.85 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  46.15 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.55 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.59 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.6 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  51.85 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.96 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.96 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.13 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  51.85 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  53.16 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  53.57 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.56 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3333  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.65 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199741  normal  0.666344 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  53.25 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  50 
 
 
232 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.16 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  47.62 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.41 
 
 
229 aa  82  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.72 
 
 
252 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2418  tonB-system energizer ExbB  52 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>