More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0841 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  44.6 
 
 		 228 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  42.06 
 
 		 231 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  42.06 
 
 		 231 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.13 
 
 		 230 aa  178  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.55 
 
 		 263 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.17 
 
 		 229 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.67 
 
 		 236 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 		 228 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 		 228 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.01 
 
 		 227 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 229 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  38.39 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.7 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  40.98 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  39.32 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  40.98 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  40.98 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  40.98 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  38.5 
 
 		 228 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.35 
 
 		 221 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  38.5 
 
 		 228 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  38.5 
 
 		 228 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  38.39 
 
 		 230 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  39.9 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  37.33 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.33 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.94 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.55 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  37.33 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.32 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  40 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  40 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38 
 
 		 228 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  40.47 
 
 		 234 aa  136  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.02 
 
 		 229 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  39.6 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  42.52 
 
 		 230 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  34.76 
 
 		 224 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  34.76 
 
 		 224 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  41.1 
 
 		 223 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  37.38 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  39.3 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.61 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  38.31 
 
 		 229 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.81 
 
 		 229 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  38.54 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  38.54 
 
 		 225 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.06 
 
 		 225 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  38.94 
 
 		 225 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  38.94 
 
 		 225 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.94 
 
 		 225 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.94 
 
 		 225 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  38.94 
 
 		 225 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  38.94 
 
 		 225 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 		 228 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  36.82 
 
 		 232 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  36.95 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.01 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.01 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  36 
 
 		 245 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  37.38 
 
 		 232 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  37.67 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  39.9 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  37.95 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  37.24 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.05 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  40.5 
 
 		 224 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  37.24 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  39.9 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  35.18 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.01 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.111367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.84 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  37.13 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  37 
 
 		 227 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  34 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  34 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  34 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  34 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  34 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  34 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  34 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  34 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  35 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  34 
 
 		 227 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2155  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.38 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 		 230 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  40 
 
 		 224 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  41.15 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.15 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>