More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1622 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  51.8 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  53.24 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  51.05 
 
 		 143 aa  151  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  51.8 
 
 		 145 aa  151  5e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  51.05 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  50.71 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  51.08 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  58.87 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  48.2 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.23 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  48.59 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  51.47 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  50.36 
 
 		 137 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  51.49 
 
 		 142 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.62 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  46.72 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.31 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.53 
 
 		 144 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.21 
 
 		 147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  47.1 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  44.29 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  45.14 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.75 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 		 148 aa  88.6  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.88 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.35 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  43.07 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.77 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  39.77 
 
 		 237 aa  72  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  39.77 
 
 		 237 aa  72  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  43.9 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.12 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.22 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  43.75 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  39.62 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  39.56 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  39.56 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  40.86 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  39.56 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  39.77 
 
 		 240 aa  67.4  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  39.58 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.46 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  34.26 
 
 		 257 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  37.63 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.89 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  50 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  41.46 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.78 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  37.35 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  40.96 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  36.19 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  39 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  37.35 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  33.33 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.9 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.21 
 
 		 607 aa  65.1  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  38.24 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.56 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.68 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  38.55 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.24 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  38.55 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  38.55 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  38.55 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.45 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.55 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  38.55 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  38.55 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  39.13 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  39.13 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  35.29 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  38 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108923  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  37.5 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  36.73 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  37.5 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  42.68 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  37.62 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  38.71 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  38.55 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  37.62 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  37.62 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  32.89 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.11 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>