More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1800 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1800  TonB system transport protein ExbB  100 
 
 
141 aa  280  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1987  TonB system transport protein ExbB  97.87 
 
 
141 aa  277  4e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1619  TonB system transport protein ExbB  97.87 
 
 
145 aa  276  5e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.794875  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0468  TonB system transport protein ExbB  76.22 
 
 
143 aa  229  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1649  TonB-system energizer ExbB  75 
 
 
145 aa  219  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.378508  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0880  TonB-system energizer ExbB  61.43 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0394  TonB-system energizer ExbB  61.31 
 
 
142 aa  179  8.000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0196312  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1240  TonB-system energizer ExbB  58.09 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  56.2 
 
 
137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1622  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.08 
 
 
170 aa  148  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.227493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  52.48 
 
 
142 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  54.26 
 
 
142 aa  140  4e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.92 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.85 
 
 
143 aa  136  8.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  51.47 
 
 
151 aa  134  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.57 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.27 
 
 
144 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.8 
 
 
147 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  45.8 
 
 
142 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  44.2 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2157  tonB-system energizer ExbB  48.15 
 
 
146 aa  116  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.683464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1569  tonB-system energizer ExbB  43.07 
 
 
144 aa  115  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.794762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  41.22 
 
 
142 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0728  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.62 
 
 
142 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.123045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.07 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.52 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  47.73 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 
555 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.75 
 
 
585 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.88 
 
 
598 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  47.73 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  46.59 
 
 
257 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 
680 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.28 
 
 
268 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.4 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  47.62 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 
655 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
671 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  46.25 
 
 
232 aa  72  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.56 
 
 
607 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.87 
 
 
594 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  42.05 
 
 
225 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2280  TonB-system energizer ExbB type-2  45.04 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  41.86 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  41.86 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  37.36 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  37.36 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  47.83 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.02 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1432  tolQ protein  43.02 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136252  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.3 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.38 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  43.02 
 
 
232 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.77 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  49.25 
 
 
232 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 
229 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.54 
 
 
231 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  39.53 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  47.83 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  48.57 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  47.06 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.48 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  48.57 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  43.02 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  43.02 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  48.57 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.02 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  43.02 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  48.57 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  42.05 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  40.7 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  40.7 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  42.11 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  40.7 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  42.11 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  47.14 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.42 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  43.24 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.14 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  38.55 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  45.21 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  47.14 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  45.35 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.58 
 
 
243 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  45.35 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  43.42 
 
 
236 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  45.35 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  45.35 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  39.24 
 
 
240 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>