More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1542 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.03 
 
 		 148 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.32 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.43 
 
 		 151 aa  171  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 		 218 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 		 209 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.49 
 
 		 251 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.52 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  53.49 
 
 		 223 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.41 
 
 		 268 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.45 
 
 		 238 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.45 
 
 		 238 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.45 
 
 		 238 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.79 
 
 		 209 aa  88.2  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  49.09 
 
 		 325 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.7 
 
 		 246 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  55.7 
 
 		 243 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.14 
 
 		 225 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.94 
 
 		 232 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.51 
 
 		 263 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 235 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  41.82 
 
 		 230 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  51.19 
 
 		 245 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 		 230 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.29 
 
 		 313 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4273  TonB-system energizer ExbB type-1  50.46 
 
 		 327 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  50 
 
 		 236 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  47.52 
 
 		 232 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  39.69 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  56.58 
 
 		 263 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.53 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.16 
 
 		 223 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.16 
 
 		 223 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.37 
 
 		 311 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 		 240 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  53.57 
 
 		 225 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  51.69 
 
 		 303 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.26 
 
 		 240 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  48.86 
 
 		 239 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  50.62 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  50.62 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  50.62 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  50.62 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  53.75 
 
 		 225 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  55 
 
 		 230 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1254  TonB-system energizer ExbB type-1  43.7 
 
 		 338 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.94 
 
 		 236 aa  83.6  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  51.16 
 
 		 224 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  53.75 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_004310  BR1666  biopolymer transport protein ExbB  43.33 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  51.16 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  50 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.11 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  41.84 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  50.62 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.85 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.55 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.28 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  50 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  45.92 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.37 
 
 		 363 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  44.21 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  44.21 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.84 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.72 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  45.37 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.37 
 
 		 355 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.84 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.85 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.72 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.72 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  55.41 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  53.75 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  46.32 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.16 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  50.62 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.84 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  50.62 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.85 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.84 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  45.98 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.84 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  45.98 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  46.32 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.09 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  50 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  48.81 
 
 		 257 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.81 
 
 		 247 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  51.85 
 
 		 259 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.15 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  48.81 
 
 		 257 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2678  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.09 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1050  biopolymer transport ExbB protein  47.37 
 
 		 251 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  51.85 
 
 		 259 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.38 
 
 		 231 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.19 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>