More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2098 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.29 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.29 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.29 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.26 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265292  hitchhiker  0.00010169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.3 
 
 		 251 aa  98.6  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.68 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  32.26 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  39.72 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.24 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1235  colicin uptake protein TolQ  30.53 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0719257  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2905  colicin uptake protein TolQ  30.04 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.46 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2871  colicin uptake protein TolQ  30 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1394  colicin uptake protein TolQ  30 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00123539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  33.82 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3090  colicin uptake protein TolQ  30.92 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0237739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1153  colicin uptake protein TolQ  29.95 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1276  colicin uptake protein TolQ  31.4 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000244479  hitchhiker  0.000166082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  29.77 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  30.43 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  29.6 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  29.6 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  29.6 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  30.43 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  31.34 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.6 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  31.34 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2959  colicin uptake protein TolQ  29.82 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0410151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  32.84 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.63 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  27.95 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.78 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  35.8 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.83 
 
 		 228 aa  88.6  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  30.88 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.77 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1246  colicin uptake protein TolQ  29.95 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0152271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  30.41 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  33.85 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0808  colicin uptake protein TolQ  30.43 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000314408  normal  0.698213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0781  colicin uptake protein TolQ  30.43 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0872  colicin uptake protein TolQ  30.43 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0427185  normal  0.214895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0903  colicin uptake protein TolQ  30.43 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000748349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0841  colicin uptake protein TolQ  30.43 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000287891  normal  0.682306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  32.72 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  31.55 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  31.55 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.06 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  30.53 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.55 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.26 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.24 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.34 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0259  biopolymer transport protein  30.39 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0316714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.8 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.03 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.41 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00697  membrane spanning protein in TolA-TolQ-TolR complex  29.47 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000447277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2898  protein TolQ  29.47 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0790  colicin uptake protein TolQ  29.47 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.9487499999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0760  colicin uptake protein TolQ  29.47 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000115881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0659  colicin uptake protein TolQ  29.47 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.56356e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.2 
 
 		 211 aa  85.1  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0766  colicin uptake protein TolQ  29.47 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000589791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0840  colicin uptake protein TolQ  29.47 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248692  normal  0.940018 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00686  hypothetical protein  29.47 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000828113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  34.24 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2918  colicin uptake protein TolQ  29.47 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000415186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  34.24 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  32.23 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.32 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0724  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.98 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.49682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.64 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  31.8 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.81 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01607  hypothetical protein  28.89 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.21 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  38.41 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.02 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.07 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  33.87 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.45 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  38.41 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.18 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.79 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.45 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.45 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  40.14 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  40.14 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.58 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  40.14 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  40.14 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  27.06 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2419  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>