More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0633 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
248 aa  503  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.44 
 
 
248 aa  411  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.26 
 
 
248 aa  401  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.85 
 
 
267 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.38391  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.45 
 
 
248 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.02 
 
 
248 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  76.61 
 
 
248 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  63.93 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.22 
 
 
279 aa  202  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.71 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.07 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  37.55 
 
 
275 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.46 
 
 
277 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.65 
 
 
274 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.94 
 
 
229 aa  102  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.78 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.63 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  30.46 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.48 
 
 
576 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.04 
 
 
218 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 
204 aa  85.1  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.58 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.73 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.95 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.01 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  26.42 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.42 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.7 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.19 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  26.07 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.89 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.76 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.24 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  30.89 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.57 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3392  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.92 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0363447  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  25.47 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  25.47 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  25.47 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  25.47 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.91 
 
 
204 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.23 
 
 
203 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.7 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  28.19 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.13 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  25.13 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  25.13 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.13 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  25.13 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.13 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  25.13 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  28.11 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  25.13 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  28.11 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  28.11 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.15 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  26.76 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.43 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  26.76 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  28.65 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.16 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.11 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2261  protein TolQ  27.43 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  24.62 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.43 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.978169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.88 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  25.47 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  25.47 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  34.68 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.19 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.2 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  27.72 
 
 
229 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.3 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  39.66 
 
 
465 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.54 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.02 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.9 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.64 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  37.04 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.15 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.87 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.13 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.24 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>