More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2300 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
215 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  43.48 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4594  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.85 
 
 
234 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0768  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  51.85 
 
 
234 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.35 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2299  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.75 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.35 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.75 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.07 
 
 
215 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  49.07 
 
 
215 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.7 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.7 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.17 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.21 
 
 
210 aa  88.2  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.17 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.17 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3610  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.93 
 
 
221 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302219  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1189  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.39 
 
 
223 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.93 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.3 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3344  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  31.5 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.67 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708114  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.21 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.39 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.9 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.94 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.18 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  29.95 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  29.95 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.47 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.77 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2098  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.73 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211471  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  30.77 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.95 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.57 
 
 
680 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.39 
 
 
655 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.95 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  30.17 
 
 
474 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  43.88 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
555 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3204  protein TolQ  44.71 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  39.64 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  41.44 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.62 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.53 
 
 
598 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.81 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.27 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.16 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.84 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.68 
 
 
671 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.09 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.6 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.18 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  28.1 
 
 
464 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  38 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  38 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  38.68 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.65 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.91 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  41.18 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 
148 aa  67  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3562  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  38.54 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.02 
 
 
585 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.45 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.63 
 
 
457 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1146  TonB-system energizer ExbB type-1  28.02 
 
 
325 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200277  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.58 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
576 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.86 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  30 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.27 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.59 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  40.59 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.27 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.47 
 
 
607 aa  65.1  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  31.09 
 
 
470 aa  65.1  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.59 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1309  putative biopolymer transport protein  29.38 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  24.64 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.59 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>