More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0351 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  100 
 
 
220 aa  434  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
220 aa  434  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  84.92 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.41 
 
 
220 aa  293  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.27 
 
 
206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.25 
 
 
253 aa  208  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.09 
 
 
214 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.53 
 
 
210 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  49.75 
 
 
211 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  49.75 
 
 
211 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.78 
 
 
204 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.5 
 
 
208 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.24 
 
 
207 aa  184  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.74 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  45.73 
 
 
201 aa  178  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.75 
 
 
210 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.22 
 
 
208 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46 
 
 
204 aa  174  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.97 
 
 
238 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.43 
 
 
209 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48 
 
 
211 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.77 
 
 
202 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.78 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  43.28 
 
 
206 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.21 
 
 
203 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.45 
 
 
224 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.87 
 
 
200 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 
206 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.97 
 
 
224 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.54 
 
 
211 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.97 
 
 
224 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.79 
 
 
206 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.44 
 
 
214 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.77 
 
 
231 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  43.94 
 
 
213 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.29 
 
 
206 aa  151  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.04 
 
 
208 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.29 
 
 
206 aa  151  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.85 
 
 
210 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.65 
 
 
192 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.08 
 
 
210 aa  141  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.24 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.62 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.62 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 
216 aa  138  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.37 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.51 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.5 
 
 
212 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.61 
 
 
244 aa  121  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.92 
 
 
214 aa  121  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.97 
 
 
339 aa  113  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.99 
 
 
238 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.26 
 
 
212 aa  104  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 
480 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  32.11 
 
 
474 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  34.47 
 
 
234 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
236 aa  99  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.36 
 
 
576 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  28.14 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  34.34 
 
 
470 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.07 
 
 
235 aa  92  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
216 aa  91.7  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.95 
 
 
171 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.12 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.14 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  34.17 
 
 
465 aa  89  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  30.77 
 
 
228 aa  89  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.9 
 
 
488 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.63 
 
 
478 aa  88.6  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.57 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.27 
 
 
234 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.21 
 
 
449 aa  85.5  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2273  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.61 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.61 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.21 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.06 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.83 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  33.67 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  28.93 
 
 
234 aa  82  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2815  biopolymer transport proteins-like  33.17 
 
 
464 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00525326  hitchhiker  0.00000294383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  31.25 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.75 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.28 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.85 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  39.82 
 
 
453 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
241 aa  79  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.91 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.79 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.64 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.78 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.79 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.19 
 
 
469 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.43 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>