More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1510 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.38 
 
 
203 aa  270  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  62.69 
 
 
202 aa  266  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.71 
 
 
201 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.64 
 
 
204 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.1 
 
 
206 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.59 
 
 
231 aa  221  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.22 
 
 
206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  51.22 
 
 
206 aa  217  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.24 
 
 
206 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.7 
 
 
210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.83 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.83 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  52.97 
 
 
213 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  53.96 
 
 
211 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  53.96 
 
 
211 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.67 
 
 
208 aa  205  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.47 
 
 
253 aa  204  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.28 
 
 
221 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.9 
 
 
210 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.43 
 
 
216 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.5 
 
 
214 aa  197  9e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.11 
 
 
207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.49 
 
 
208 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.76 
 
 
208 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  57.67 
 
 
214 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.77 
 
 
238 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.36 
 
 
212 aa  187  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.25 
 
 
209 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.26 
 
 
192 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.33 
 
 
204 aa  185  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.24 
 
 
210 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.76 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.03 
 
 
200 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
211 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.27 
 
 
210 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49 
 
 
224 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.5 
 
 
224 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.28 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.73 
 
 
220 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  45.73 
 
 
220 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.57 
 
 
207 aa  160  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 
212 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.5 
 
 
220 aa  154  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  44.5 
 
 
220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.34 
 
 
206 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.34 
 
 
206 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.12 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 
214 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.29 
 
 
244 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.62 
 
 
241 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  35.6 
 
 
474 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.64 
 
 
339 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.06 
 
 
206 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32 
 
 
238 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.64 
 
 
576 aa  101  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  42.19 
 
 
470 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.59 
 
 
480 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.12 
 
 
235 aa  91.3  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.99 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.65 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.05 
 
 
246 aa  88.6  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.71 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.67 
 
 
229 aa  88.6  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.59 
 
 
274 aa  88.2  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
209 aa  87.8  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0899  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  32.67 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.46 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0443122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.65 
 
 
196 aa  85.1  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0548  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.71 
 
 
263 aa  84.7  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.477361  normal  0.119792 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  34.52 
 
 
234 aa  84.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  36.57 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.31 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  30.61 
 
 
465 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.2 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.83 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.5 
 
 
251 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  37.98 
 
 
455 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.37 
 
 
252 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.37 
 
 
252 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.26 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.26 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.37 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.26 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.5 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.56 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.84 
 
 
457 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.61 
 
 
233 aa  79  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.98 
 
 
457 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  36.72 
 
 
451 aa  78.6  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0353  TonB system biopolymer transport component  36.76 
 
 
460 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.899068  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  29.53 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03434  putative Tol protein  39.52 
 
 
454 aa  78.2  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>