More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3762 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
268 aa  540  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.15 
 
 
274 aa  242  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.39 
 
 
324 aa  155  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.53 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.57 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.26 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
209 aa  85.5  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.78 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.76 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.04 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
208 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.21 
 
 
208 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.25 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.51 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  30.56 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  26.9 
 
 
211 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  26.9 
 
 
211 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.71 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 
221 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.45 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.19 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.49 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.43 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.28 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.71 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.71 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.49 
 
 
218 aa  72  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
210 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0548  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.43 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.477361  normal  0.119792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.73 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  27.62 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.14 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  29.63 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.96 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  27.96 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  29.8 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.41 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.31 
 
 
192 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.47 
 
 
216 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.89 
 
 
233 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  45.12 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  38.71 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.23 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.23 
 
 
220 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  37.38 
 
 
236 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0460  MotA/TolQ/ExbB proton channel  20.85 
 
 
230 aa  62.4  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.19 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  31.21 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.22 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  24.26 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  39.13 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 
480 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.41 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.54 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.41 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.41 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.63 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.63 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.63 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.66 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.46 
 
 
457 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1737  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.74 
 
 
201 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  22.55 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3310  tonB-system energizer ExbB  38.41 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885209  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.51 
 
 
576 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 
363 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.86 
 
 
223 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.67 
 
 
212 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.9 
 
 
488 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  35.16 
 
 
349 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  22.73 
 
 
204 aa  58.9  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
355 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  37.6 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  35.48 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  34.55 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  35.48 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.94 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  29.46 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.54 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.78 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0727  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.48 
 
 
431 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242585  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.6 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>