More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4465 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  87.39 
 
 
226 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.05 
 
 
216 aa  195  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2957  biopolymer transport proteins-like  40.18 
 
 
242 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  41.58 
 
 
220 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.1 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.26 
 
 
235 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3073  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.49 
 
 
211 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1598  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.78 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506582  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3392  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0363447  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1228  putative adventurous gliding motility protein R  47.86 
 
 
217 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258731  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
253 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.35 
 
 
238 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.55 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.39 
 
 
576 aa  98.6  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  33.33 
 
 
275 aa  95.9  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.44 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.77 
 
 
480 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  32.07 
 
 
234 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.03 
 
 
218 aa  85.5  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
280 aa  85.1  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.9 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  40.71 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.7 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  30.54 
 
 
470 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.04 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  32.63 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  32.63 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  26.26 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.91 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.59 
 
 
453 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3755  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.93 
 
 
449 aa  79.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.83 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.88 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.13 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  36.59 
 
 
453 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  30.41 
 
 
236 aa  78.6  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.22 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.3 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  28.35 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  29.29 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35 
 
 
449 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  29.29 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.63 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.7 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.55 
 
 
339 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.64 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  26.42 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  30.93 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.21 
 
 
478 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.16 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.84 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.38391  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.15 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  35.59 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.26 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.55 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  34.88 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.64 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  31.64 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.05 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.59 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.05 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.23 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.14 
 
 
457 aa  71.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  31.51 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.19 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.8 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.12 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.12 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.18 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.69 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0563  protein TolQ  30.3 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.533269  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  29.08 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.91 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.91 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.37 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.91 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>