More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0570 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  99.19 
 
 
267 aa  497  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.38391  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.05 
 
 
248 aa  424  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  81.45 
 
 
248 aa  417  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  83.47 
 
 
248 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.63 
 
 
248 aa  410  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  79.44 
 
 
248 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  60.66 
 
 
247 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  42.17 
 
 
275 aa  208  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.28 
 
 
279 aa  207  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.41 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.66 
 
 
277 aa  195  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.06 
 
 
274 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  31.28 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 
576 aa  91.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
209 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
204 aa  87  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.23 
 
 
235 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.67 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.94 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.46 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.22 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.84 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.84 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.84 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.24 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.15 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.54 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  28.16 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.33 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.65 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.3 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3392  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.5 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0363447  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.79 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.65 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.72 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  27.03 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1917  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2270  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.84 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  30 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.67 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.46 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.550239  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2672  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.866778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  25.76 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.76 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.41 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.06 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  25.79 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.26 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.94 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  25.79 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.79 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.79 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.99 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  25.79 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  29.51 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  25.79 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  25.79 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.64 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2613  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.64 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  31.54 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3003  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.64 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.89 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.98 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.44 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  25.26 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  28.09 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.85 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  28.09 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.08 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.36 
 
 
208 aa  72  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  24.75 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.09 
 
 
252 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  29.51 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  25.25 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.51 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  25.25 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.89 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  25.25 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  25.25 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  29.51 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  29.51 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.19 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  29.63 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.58 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  26.73 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.2 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  28.96 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.8 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1728  tolQ protein  26.77 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.59 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>