More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0561 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 
257 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.83 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.5 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  39.38 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.69 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  36.22 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.5 
 
 
200 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 
308 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.1 
 
 
308 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.1 
 
 
308 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
208 aa  104  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.14 
 
 
204 aa  104  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.79 
 
 
230 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.27 
 
 
249 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 
208 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  35.2 
 
 
211 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  35.2 
 
 
211 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.16 
 
 
339 aa  101  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.82 
 
 
253 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  36.02 
 
 
470 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.07 
 
 
233 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.67 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.8 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.51 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 
480 aa  95.9  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.67 
 
 
218 aa  95.1  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.03 
 
 
238 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.06 
 
 
224 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.26 
 
 
206 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.19 
 
 
197 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.26 
 
 
206 aa  94  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.66 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.04 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.56 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.07 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.52 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.1 
 
 
236 aa  92.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.29 
 
 
246 aa  91.7  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 
224 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.19 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  30.05 
 
 
474 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.84 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0507  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.68 
 
 
249 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.23 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
235 aa  88.6  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.21 
 
 
243 aa  88.6  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.06 
 
 
236 aa  87.8  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.369389  normal  0.337836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.46 
 
 
226 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  31.82 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.16 
 
 
280 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.73 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  32.04 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.24 
 
 
279 aa  85.9  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.24 
 
 
221 aa  85.1  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
576 aa  85.5  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.9 
 
 
224 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.9 
 
 
224 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.9 
 
 
224 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.2 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.2 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.12 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.7 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.19 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.21 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
286 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.96 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.05 
 
 
457 aa  81.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  31.05 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.95 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.57 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  30.57 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4034  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.133642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.66 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27 
 
 
222 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1848  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.74 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.775268  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.46 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.4 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.59 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.31 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_002950  PG0782  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  30.05 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.01 
 
 
453 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  37.01 
 
 
453 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.72 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3073  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.19 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  27 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.52 
 
 
449 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>