More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1588 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 
248 aa  503  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0169562 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1963  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.66 
 
 
248 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0603  MotA/TolQ/ExbB proton channel  80.65 
 
 
248 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0729  MotA/TolQ/ExbB proton channel  83.27 
 
 
248 aa  407  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.535753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  76.61 
 
 
248 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.44 
 
 
267 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.38391  normal  0.963461 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  79.44 
 
 
248 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.320188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0549  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  60.98 
 
 
247 aa  295  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.23318  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2018  biopolymer transport protein  41.83 
 
 
275 aa  210  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.57 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.13 
 
 
277 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0347861  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1426  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.55 
 
 
286 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0493  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
274 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  34.29 
 
 
229 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.11 
 
 
238 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.74 
 
 
204 aa  92  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  28.64 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.95 
 
 
235 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
576 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 
241 aa  85.5  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.2 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.84 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.34 
 
 
226 aa  82  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02770  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.15 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.06 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.16 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.14 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.91 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.62 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.53 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  32.28 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.5 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.03 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.05 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  31.46 
 
 
206 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1976  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.35 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.254375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.04 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.32 
 
 
324 aa  75.5  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.37 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3392  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0363447  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.45 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.16 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.95 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.86 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3253  tolQ protein  25.63 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.73 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  25.63 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  25.63 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.15 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.63 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.63 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.43 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  25.63 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  25.63 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  24.88 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  25.63 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3122  protein TolQ  34.62 
 
 
259 aa  72  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  29.32 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2227  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.63 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260682  hitchhiker  0.000349255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2452  protein TolQ  28.76 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0680  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.1 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  37.04 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.22 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  39.78 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  26.88 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.75 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3917  biopolymer MotA/TolQ/ExbB proton channel family transporter  28.76 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22506  normal  0.159351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0762  protein TolQ  28.76 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167492  normal  0.258035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0697  protein TolQ  28.1 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.22 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  25.71 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.71 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.96 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  26.76 
 
 
470 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.68 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.36 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.68 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  26.13 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.68 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.14 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01561  protein TolQ  41.67 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.25 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3892  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.45 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  35.16 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  38.46 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  39.62 
 
 
465 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  26.34 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  36.84 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2584  protein TolQ  27.45 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.922054  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0320  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.45 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>